在PCR產(chǎn)物的克隆中,Lambda核酸外切酶(λExonuclease)有其特定的應(yīng)用和優(yōu)勢(shì),但它不能完全替代其他酶。以下是一些替代酶和它們的特點(diǎn):1.**ExonucleaseIII(ExoIII)**:-ExoIII具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,尤其適合雙鏈DNA的平末端、5'-突出末端或切口,從DNA鏈的3'-端釋放5'-單磷酸核苷酸,產(chǎn)生單鏈DNA片段。-與Lambda核酸外切酶相比,ExoIII對(duì)具有3'-突出末端的DNA有活性,而Lambda核酸外切酶則對(duì)5'-磷酸化的雙鏈DNA有更高的活性。2.**TaqDNA聚合酶**:-在平端克隆中,可以使用TaqDNA聚合酶和dATP進(jìn)行“3'dA加尾”,以提高連接效率。-這種方法通過在PCR產(chǎn)物的3'端添加突出的腺嘌呤(dA),增加了與載體連接的可能性,從而提高克隆效率。3.**TOPO克隆載體**:-TOPO克隆載體含有共價(jià)連接的DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I,可同時(shí)作為限制性內(nèi)切酶和連接酶。-與傳統(tǒng)PCR克隆載體相比,TOPO克隆載體具有更短的連接反應(yīng)時(shí)間、更高的克隆效率以及更簡(jiǎn)單的分子克隆實(shí)驗(yàn)方案。綜上所述,雖然Lambda核酸外切酶在特定情況下非常有用,但它不能完全替代其他酶。每種酶都有其獨(dú)特的特性和應(yīng)用場(chǎng)景,選擇合適的酶取決于具體的克隆需求和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。泛素分子可以通過其內(nèi)部的賴氨酸殘基(如Lys48)與其他泛素分子形成多聚泛素鏈。Recombinant Cynomolgus/Rhesus macaque EpCAM/TROP1 Protein
提取的病毒核酸可以直接用于多種實(shí)驗(yàn),主要包括:1.**實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)**:這是一種常用的技術(shù),可以對(duì)病毒核酸進(jìn)行定量檢測(cè)。它通過實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR過程中的熒光信號(hào)來確定病毒核酸的數(shù)量。例如,病毒核酸檢測(cè)就是基于此技術(shù),通過設(shè)計(jì)特異性引物和探針,對(duì)病毒的靶基因進(jìn)行定性檢測(cè)。2.**逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)**:這項(xiàng)技術(shù)用于檢測(cè)RNA病毒,通過將病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以檢測(cè)病毒的存在。RT-PCR技術(shù)靈敏而且用途廣,可以用于檢測(cè)細(xì)胞、組織中RNA病毒的含量。3.**等溫?cái)U(kuò)增法**:包括環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)和切口延伸等溫?cái)U(kuò)增(NEAR),這些方法在恒溫條件下進(jìn)行,無需復(fù)雜的設(shè)備,適用于快速、現(xiàn)場(chǎng)的病毒核酸檢測(cè)。4.**數(shù)字PCR(dPCR)**:這是一種高度靈敏的技術(shù),可以對(duì)病毒核酸進(jìn)行定量。它通過將樣本分配到成千上萬的微小反應(yīng)室中,每個(gè)反應(yīng)室單獨(dú)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒核酸的精確計(jì)數(shù)。5.**核酸雜交技術(shù)**:如熒光原位雜交(FISH),可以用于檢測(cè)特定病毒核酸序列在細(xì)胞或組織中的存在和定位。Recombinant Human CADM1/IGSF4A Protein,His TagTaq DNA Polymerase 能夠在相對(duì)較高的溫度下保持穩(wěn)定,其適催化溫度在75-80°C。
磁珠法PCR/DNA純化試劑盒與傳統(tǒng)純化方法相比具有以下優(yōu)勢(shì):1.**操作簡(jiǎn)便快捷**:磁珠法純化過程通常可以在15分鐘內(nèi)完成,包括結(jié)合、洗滌和洗脫步驟,無需復(fù)雜的離心或抽濾操作。2.**高純度和高回收率**:磁珠法純化得到的DNA純度高,通常回收率可以達(dá)到90%以上,適用于100bp以上的DNA片段的純化,對(duì)達(dá)到10kb片段DNA的純化也能保持較好的效果。3.**適用性廣**:磁珠法PCR/DNA純化試劑盒適用于多種樣本類型,包括PCR產(chǎn)物、酶切產(chǎn)物、連接產(chǎn)物等,也適用于低濃度樣品的濃縮。4.**安全性高**:操作過程中不涉及酚/氯仿等有毒試劑,更加環(huán)保和安全。5.**靈活性**:可以根據(jù)實(shí)際狀況靈活調(diào)節(jié)磁珠用量,適應(yīng)不同體積和濃度的樣品處理。6.**自動(dòng)化和高通量**:磁珠法純化試劑盒適合手工操作,也可用于自動(dòng)化工作站或核酸自動(dòng)提取儀,實(shí)現(xiàn)高通量操作。7.**溫和的條件**:磁珠法條件溫和,對(duì)DNA的損傷小,適合后續(xù)的多種分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),如酶切、連接、轉(zhuǎn)化細(xì)菌、測(cè)序、PCR、雜交等。8.DNA片段適應(yīng)性**:適用于從150bp到50kb的DNA片段的純化,能夠滿足大多數(shù)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的需求。
T5核酸外切酶在基因克隆中的優(yōu)勢(shì)主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:1.**高效性**:T5核酸外切酶依賴性組裝(TEDA)方法在常規(guī)克隆中的效率與使用專有DNA聚合酶的商業(yè)In-Fusion方法相似,但高于使用T5核酸外切酶、PhusionDNA聚合酶和DNA連接酶的Gibson方法。2.**低成本**:TEDA方法每個(gè)反應(yīng)使用0.04U的T5核酸外切酶,價(jià)格為0.25美分,具有很高的成本效益。3.**簡(jiǎn)單性**:TEDA方法的反應(yīng)混合物非常簡(jiǎn)單,易于操作,這使得它在預(yù)算有限的實(shí)驗(yàn)室中尤其有用。4.**靈活性**:TEDA方法能夠組裝多個(gè)DNA片段,并在多個(gè)位點(diǎn)同時(shí)進(jìn)行定點(diǎn)誘變,提供了一種靈活的克隆和突變方法。5.**陽(yáng)性克隆率**:使用T5核酸外切酶的無縫克隆技術(shù)可以確保100%的陽(yáng)性克隆率,這提高了實(shí)驗(yàn)的成功率。6.**協(xié)同作用**:在無縫克隆中,T5核酸外切酶與Phusion高保真DNA聚合酶和TaqDNA連接酶協(xié)同作用,通過切割、填補(bǔ)和連接三個(gè)步驟,高效地完成DNA片段的連接。7.**減少污染**:T5核酸外切酶可以降解堿裂解提取質(zhì)粒中的變性DNA,減少超螺旋DNA的污染,提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。這些優(yōu)勢(shì)使得T5核酸外切酶成為基因克隆中一個(gè)非常有價(jià)值的工具,尤其是在需要高效、低成本和操作簡(jiǎn)便的實(shí)驗(yàn)環(huán)境中。在這個(gè)過程中,E1使用ATP的能量,在自身的活性位點(diǎn)的半胱氨酸殘基與泛素C末端的甘氨酸殘基形成硫酯鍵。
牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)與細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶的主要區(qū)別如下:1.**來源不同**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I來源于牛痘病毒,是一種真核生物病毒中的酶。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶則來源于原核生物,如大腸桿菌的ω蛋白等。2.**功能特性**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I能夠解旋DNA的超螺旋結(jié)構(gòu),并且識(shí)別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物,遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后,重新連接形成完整DNA鏈。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶,如大腸桿菌的ω蛋白,主要功能是催化DNA鏈斷開和結(jié)合的偶聯(lián)反應(yīng),以改變DNA的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。3.**活性條件**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I即使在Mg2+不存在的條件下也顯示活性。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶可能需要Mg2+等金屬離子作為輔因子來發(fā)揮活性。4.**作用的DNA鏈**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I能使正負(fù)兩方的超螺旋分子均形成松散型。-原核生物由來的DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I只作用負(fù)鏈的超螺旋分子。5.**共價(jià)鍵形成**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I與DNA形成共價(jià)連接,此酯鍵中所貯存的能量可能在切斷端的再結(jié)合上起著作用。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶在原核生物中是游離型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端與酶形成共價(jià)鍵。
Pfu DNA Polymerase的熱穩(wěn)定性和保真性使其在優(yōu)化PCR條件時(shí)更為靈活,比如在GC含量較高的模板中。Recombinant Mouse CALCA/CGRP Protein,hFc Tag
在某些糖蛋白的純化方案中,利用 Endo H 對(duì)糖鏈的特異性水解作用,去除糖蛋白上的糖鏈。Recombinant Cynomolgus/Rhesus macaque EpCAM/TROP1 Protein
牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)是一種來源于牛痘病毒的I型真核拓?fù)洚悩?gòu)酶,具有以下功能和應(yīng)用:1.**功能**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以催化雙鏈DNA分子中單鏈DNA特定序列位置的磷酸二酯鍵的斷開和連接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性,能夠通過快速的酶切和連接使雙鏈共價(jià)閉合環(huán)狀的正或負(fù)超螺旋DNA發(fā)生解超螺旋,形成含有較少的正或負(fù)超螺旋的雙鏈環(huán)狀DNA分子。-能夠使雙鏈DNA形成繩結(jié)(knotting)或解開繩結(jié)(unknotting),聯(lián)結(jié)互補(bǔ)的單鏈環(huán)狀DNA成為雙鏈環(huán)狀DNA。2.**應(yīng)用**:-作為一種DNA重組連接的新型工具酶,用于DNA載體和重組片段的連接、缺刻修復(fù)、接頭連接等。-適用于TOPO克隆載體的制備、NGS建庫(kù)中的接頭連接等。-在TOPO克隆技術(shù)中,DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I同時(shí)具有限制酶和連接酶特性,其生物學(xué)功能是在復(fù)制期間切割并重新連接DNA。3.**使用方法**:-用于DNA快速酶切流程,包括配制體系反應(yīng)液、輕柔混勻、37℃孵育15分鐘等步驟。4.**儲(chǔ)存條件**:-建議在-25~-15℃保存,有效期為3年。5.**注意事項(xiàng)**:-避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止酶失活。牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I因其獨(dú)特的功能,在分子生物學(xué)研究和基因工程中扮演著重要的角色。Recombinant Cynomolgus/Rhesus macaque EpCAM/TROP1 Protein